Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HDDC3Q8N4P3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HDDC3Q8N4P3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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