Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NPAS3Q8IXF0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms