Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PBRM1Q86U86 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PBRM1Q86U86 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms