Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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TRAPPC6BQ86SZ2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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TRAPPC6BQ86SZ2 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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TRAPPC6BQ86SZ2 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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TRAPPC6BQ86SZ2 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRAPPC6BQ86SZ2 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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