Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BHLHA9Q7RTU4 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms