Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TCF23Q7RTU1 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TCF23Q7RTU1 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms