Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTOP1Q7RTM1 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTOP1Q7RTM1 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms