Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
TMUB2Q71RG4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms