Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
C16orf54Q6UWD8 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms