Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CENPPQ6IPU0 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms