Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATG16L1Q676U5 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms