Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms