Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC38Q502W7 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 440.5 ms