Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FOXD4L6Q3SYB3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4L6Q3SYB3 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4L6Q3SYB3 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4L6Q3SYB3 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4L6Q3SYB3 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4L6Q3SYB3 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4L6Q3SYB3 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4L6Q3SYB3 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4L6Q3SYB3 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4L6Q3SYB3 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4L6Q3SYB3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4L6Q3SYB3 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4L6Q3SYB3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4L6Q3SYB3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4L6Q3SYB3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4L6Q3SYB3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4L6Q3SYB3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4L6Q3SYB3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4L6Q3SYB3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4L6Q3SYB3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4L6Q3SYB3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4L6Q3SYB3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4L6Q3SYB3 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4L6Q3SYB3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4L6Q3SYB3 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4L6Q3SYB3 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4L6Q3SYB3 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4L6Q3SYB3 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4L6Q3SYB3 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4L6Q3SYB3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4L6Q3SYB3 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4L6Q3SYB3 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4L6Q3SYB3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4L6Q3SYB3 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4L6Q3SYB3 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4L6Q3SYB3 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4L6Q3SYB3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXD4L6Q3SYB3 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms