Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HIF1AQ16665 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HIF1AQ16665 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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