Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AC015912.3-201ENST00000619432 348 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
ZFHX3Q15911 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms