Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ATP6AP1Q15904 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ATP6AP1Q15904 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms