Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
USF2Q15853 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
USF2Q15853 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 KCNA1-201ENST00000382545 7997 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
USF2Q15853 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
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