Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC85BQ15834 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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