Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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TAF11Q15544 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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TAF11Q15544 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TAF11Q15544 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TAF11Q15544 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TAF11Q15544 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TAF11Q15544 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TAF11Q15544 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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TAF11Q15544 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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TAF11Q15544 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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TAF11Q15544 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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TAF11Q15544 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TAF11Q15544 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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