Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SKIV2LQ15477 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms