Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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SIX1Q15475 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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SIX1Q15475 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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