Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SEC23BQ15437 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.2 ms