Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.617e-8■■■□□ 15.2
PCBP2Q15366 RXRB-204ENST00000483281 1977 ntTSL 520.09■□□□□ 0.812e-7■■■□□ 15.2
PCBP2Q15366 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.462e-7■■■□□ 15.2
PCBP2Q15366 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.262e-7■■■□□ 15.2
PCBP2Q15366 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.023e-7■■■□□ 15.2
PCBP2Q15366 AMPD2-215ENST00000526301 2354 ntTSL 1 (best)13.75□□□□□ -0.213e-7■■■□□ 15.2
PCBP2Q15366 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.273e-7■■■□□ 15.2
PCBP2Q15366 AMPD2-203ENST00000358729 2838 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.453e-7■■■□□ 15.2
PCBP2Q15366 AMPD2-201ENST00000256578 3899 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.663e-7■■■□□ 15.2
PCBP2Q15366 AMPD2-202ENST00000342115 3728 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.693e-7■■■□□ 15.2
PCBP2Q15366 AMPD2-204ENST00000369840 3130 ntAPPRIS ALT2 TSL 510.29□□□□□ -0.763e-7■■■□□ 15.2
PCBP2Q15366 LINC01399-201ENST00000423311 648 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.996e-6■■■□□ 15.2
PCBP2Q15366 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.391e-6■■■□□ 15.2
PCBP2Q15366 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.041e-6■■■□□ 15.2
PCBP2Q15366 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.351e-6■■■□□ 15.2
PCBP2Q15366 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.142e-7■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.092e-7■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 GPX3-206ENST00000521632 1314 ntTSL 514.21□□□□□ -0.132e-7■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.152e-7■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 NUP214-203ENST00000451030 5021 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.733e-7■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 NUP214-201ENST00000359428 7600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.093e-7■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.193e-7■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 NUP214-224ENST00000530863 560 ntTSL 55□□□□□ -1.613e-7■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 HUWE1-202ENST00000262854 14739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.826e-7■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.336e-7■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.47e-13■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.297e-13■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 B9D1-212ENST00000574508 496 ntTSL 316.5■□□□□ 0.235e-7■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.055e-7■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.055e-7■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.25e-7■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.335e-7■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 B9D1-215ENST00000582857 495 ntTSL 411.99□□□□□ -0.495e-7■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.55e-7■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 B9D1-210ENST00000477683 618 ntTSL 1 (best)11.58□□□□□ -0.565e-7■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 B9D1-205ENST00000440841 601 ntTSL 511.3□□□□□ -0.65e-7■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 B9D1-204ENST00000395616 733 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.615e-7■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 B9D1-214ENST00000575478 553 ntTSL 211.26□□□□□ -0.615e-7■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 B9D1-213ENST00000575403 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.75e-7■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 COL27A1-202ENST00000451716 2865 ntTSL 1 (best)11.84□□□□□ -0.512e-16■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.348e-8■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.26e-7■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 UBE2D3-216ENST00000503742 1977 ntTSL 1 (best)21.05■□□□□ 0.969e-8■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 UBE2D3-214ENST00000503282 584 ntTSL 220.84■□□□□ 0.939e-8■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 UBE2D3-229ENST00000510129 582 ntTSL 320.09■□□□□ 0.819e-8■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.789e-8■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 UBE2D3-220ENST00000505307 743 ntTSL 518.47■□□□□ 0.559e-8■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 UBE2D3-228ENST00000508974 568 ntTSL 413.8□□□□□ -0.29e-8■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 BCL2L2-204ENST00000556599 548 ntTSL 317.66■□□□□ 0.421e-11■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.335e-11■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.265e-11■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.895e-11■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.575e-11■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.575e-11■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 YWHAH-205ENST00000471374 1735 ntTSL 218.29■□□□□ 0.525e-11■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 CCDC86-202ENST00000535217 1488 ntTSL 516.73■□□□□ 0.271e-7■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 PDP2-206ENST00000566805 558 ntTSL 416.35■□□□□ 0.215e-11■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.195e-11■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.13e-6■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.025e-11■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 ZBTB44-203ENST00000445008 3848 ntTSL 1 (best)14.34□□□□□ -0.115e-11■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 PDP2-208ENST00000568720 917 ntTSL 314.07□□□□□ -0.165e-11■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.191e-7■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 FIP1L1-212ENST00000513975 1464 ntTSL 213.65□□□□□ -0.225e-11■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 FIP1L1-205ENST00000505125 3180 ntTSL 1 (best)13.41□□□□□ -0.265e-11■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 AC124319.2-202ENST00000572151 569 ntTSL 413.21□□□□□ -0.295e-11■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.375e-11■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 PDP2-201ENST00000311765 7146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.665e-11■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 ZBTB44-205ENST00000525842 9315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.665e-11■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 PDP2-202ENST00000561475 1014 ntTSL 39.52□□□□□ -0.895e-11■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 AC124319.2-201ENST00000575034 3651 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.015e-11■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 FIP1L1-204ENST00000504094 2177 ntTSL 25.62□□□□□ -1.515e-11■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 FIP1L1-213ENST00000514543 1465 ntTSL 54.57□□□□□ -1.685e-11■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 FIP1L1-211ENST00000513008 1070 ntTSL 1 (best)3.77□□□□□ -1.815e-11■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 CELF1-213ENST00000530151 583 ntTSL 320.46■□□□□ 0.875e-7■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 CELF1-210ENST00000526419 476 ntTSL 417.1■□□□□ 0.335e-7■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 CELF1-208ENST00000525841 622 ntTSL 513.91□□□□□ -0.185e-7■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.057e-7■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 CSNK2B-205ENST00000465481 579 ntTSL 1 (best)13.63□□□□□ -0.238e-11■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 CSNK2B-207ENST00000475875 590 ntTSL 1 (best)13.63□□□□□ -0.238e-11■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 CSNK2B-208ENST00000481269 785 ntTSL 210.77□□□□□ -0.698e-11■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 STK35-202ENST00000493263 1595 ntTSL 1 (best)20.34■□□□□ 0.854e-9■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.144e-9■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.051e-6■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.422e-8■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.421e-6■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 RNF44-202ENST00000504160 887 ntTSL 316.16■□□□□ 0.182e-8■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.481e-6■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 SLC25A39-215ENST00000592372 867 ntTSL 315.9■□□□□ 0.148e-13■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.072e-7■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.162e-7■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 WNK1-219ENST00000545285 528 ntTSL 39.64□□□□□ -0.873e-6■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 SRGAP2-203ENST00000573034 6301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.032e-9■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 WNK1-217ENST00000544965 653 ntTSL 37.77□□□□□ -1.173e-6■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 WNK1-214ENST00000542543 506 ntTSL 26.67□□□□□ -1.343e-6■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 WNK1-207ENST00000535698 736 ntTSL 35.8□□□□□ -1.483e-6■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 STARD13-202ENST00000336934 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.492e-6■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 STARD13-206ENST00000487412 939 ntTSL 1 (best)9.8□□□□□ -0.842e-6■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 STARD13-208ENST00000498019 568 ntTSL 38.97□□□□□ -0.972e-6■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 TNS3-211ENST00000474346 775 ntTSL 312.01□□□□□ -0.495e-7■■■□□ 15.1
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