Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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CHD4Q14839 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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CHD4Q14839 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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CHD4Q14839 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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CHD4Q14839 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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CHD4Q14839 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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CHD4Q14839 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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CHD4Q14839 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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CHD4Q14839 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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