Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NBR1Q14596 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms