Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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GBX1Q14549 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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GBX1Q14549 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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GBX1Q14549 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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GBX1Q14549 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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GBX1Q14549 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GBX1Q14549 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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