Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRIM29Q14134 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRIM29Q14134 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms