Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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CKAP5Q14008 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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CKAP5Q14008 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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