Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PKP1Q13835 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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