Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
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SHROOM2Q13796 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
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SHROOM2Q13796 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
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SHROOM2Q13796 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
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SHROOM2Q13796 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
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SHROOM2Q13796 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
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SHROOM2Q13796 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
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SHROOM2Q13796 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHROOM2Q13796 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
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