Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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APOFQ13790 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOFQ13790 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
APOFQ13790 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOFQ13790 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOFQ13790 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOFQ13790 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOFQ13790 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOFQ13790 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOFQ13790 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOFQ13790 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOFQ13790 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOFQ13790 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOFQ13790 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOFQ13790 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOFQ13790 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOFQ13790 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOFQ13790 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOFQ13790 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOFQ13790 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
APOFQ13790 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
APOFQ13790 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APOFQ13790 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APOFQ13790 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APOFQ13790 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
APOFQ13790 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APOFQ13790 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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APOFQ13790 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APOFQ13790 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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APOFQ13790 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APOFQ13790 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APOFQ13790 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
APOFQ13790 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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APOFQ13790 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
APOFQ13790 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
APOFQ13790 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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APOFQ13790 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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APOFQ13790 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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APOFQ13790 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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APOFQ13790 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
APOFQ13790 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
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