Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEUROD1Q13562 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEUROD1Q13562 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms