Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 BUB1B-201ENST00000287598 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.865e-9■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 PPIA-206ENST00000480603 842 ntTSL 39.56□□□□□ -0.885e-9■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 UBE4B-202ENST00000343090 5267 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.995e-17■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 NDUFA4-205ENST00000486007 434 ntTSL 26.69□□□□□ -1.345e-9■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 FASN-205ENST00000584610 857 ntTSL 222.66■■□□□ 1.221e-18■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 FASN-202ENST00000578424 951 ntTSL 221.97■■□□□ 1.111e-18■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 CSTB-202ENST00000480147 2344 nt23.42■■□□□ 1.344e-12■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.624e-12■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 CSTB-203ENST00000639959 1855 ntTSL 517.6■□□□□ 0.414e-12■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.234e-12■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 CDK4-213ENST00000552713 685 ntTSL 210.53□□□□□ -0.722e-8■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 ZRANB2-202ENST00000370920 3078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.732e-8■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.492e-8■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 ZRANB2-204ENST00000477096 3677 ntTSL 1 (best)1.99□□□□□ -2.092e-8■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.092e-7■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 12e-7■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 UBE2E1-203ENST00000424381 1224 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.682e-7■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 UBE2E1-205ENST00000452012 1166 ntTSL 38.37□□□□□ -1.072e-7■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.33e-6■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 COPE-204ENST00000593827 601 ntTSL 324.18■■□□□ 1.462e-6■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 H2AFZ-206ENST00000529158 726 ntTSL 312.33□□□□□ -0.444e-16■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 UBE2B-207ENST00000510021 415 ntTSL 219.49■□□□□ 0.712e-6■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 UBE2B-208ENST00000511807 818 ntTSL 313.64□□□□□ -0.232e-6■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 FAM222B-209ENST00000581407 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.342e-6■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 UBE2B-205ENST00000506787 500 ntTSL 312.7□□□□□ -0.382e-6■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 FAM222B-201ENST00000341217 4033 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.822e-6■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 UBE2B-204ENST00000504431 235 ntTSL 28.87□□□□□ -0.992e-6■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 ATP5B-203ENST00000547808 705 ntTSL 523.16■■□□□ 1.33e-68■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 CCT6A-203ENST00000462133 665 ntTSL 313.4□□□□□ -0.261e-23■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 CCT6A-204ENST00000466479 745 ntTSL 29.18□□□□□ -0.941e-23■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 CCT6A-209ENST00000494736 411 ntTSL 27.76□□□□□ -1.171e-23■□□□□ 9.2
PABPC4Q13310 CHID1-214ENST00000528534 321 ntTSL 315.99■□□□□ 0.154e-6■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 CHID1-210ENST00000526714 976 ntTSL 512.27□□□□□ -0.454e-6■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 CHID1-213ENST00000528521 323 ntTSL 511.69□□□□□ -0.544e-6■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 PSMD5-201ENST00000210313 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11e-14■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 PSMD5-204ENST00000373920 569 ntTSL 56.71□□□□□ -1.341e-14■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.311e-15■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 FOXK2-202ENST00000473637 3462 ntTSL 1 (best)22■■□□□ 1.111e-15■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 FOXK2-205ENST00000529652 2199 ntTSL 217.94■□□□□ 0.461e-15■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.24e-30■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 FOXK2-212ENST00000624186 4244 nt13.66□□□□□ -0.221e-15■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 C7orf55-LUC7L2-201ENST00000541515 1661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.714e-30■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 CDC37-206ENST00000589629 728 ntTSL 317.02■□□□□ 0.323e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 KDM1A-205ENST00000494920 905 ntTSL 312.93□□□□□ -0.342e-6■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.291e-28■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.091e-28■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 YWHAE-202ENST00000466227 1377 ntTSL 510.71□□□□□ -0.691e-28■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 EIF5A-207ENST00000572815 811 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.046e-18■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 PRR13-202ENST00000429243 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.131e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 PRR13-201ENST00000379786 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.451e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 AC023509.1-201ENST00000547717 1571 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.461e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 PRR13-210ENST00000551003 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.671e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 PRR13-203ENST00000546581 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.861e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 PRR13-207ENST00000549581 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.861e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 PRR13-205ENST00000549068 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.931e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.856e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.182e-17■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.242e-19■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 SPR-202ENST00000498749 947 ntTSL 325.49■■□□□ 1.671e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 EXOC3-203ENST00000505947 845 ntTSL 224.48■■□□□ 1.511e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.184e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.961e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 PCYT2-215ENST00000573927 778 ntTSL 319.72■□□□□ 0.751e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.531e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.431e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 CAPN2-212ENST00000498027 1405 ntTSL 217.52■□□□□ 0.41e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.371e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.361e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.241e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.241e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.211e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 COX17-202ENST00000468918 555 ntTSL 416.22■□□□□ 0.191e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.171e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.171e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.074e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.061e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.031e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.061e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 COX17-205ENST00000490145 513 ntTSL 514.06□□□□□ -0.161e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 COX17-201ENST00000261070 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.171e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 PRR3-206ENST00000498336 2005 ntTSL 313.93□□□□□ -0.181e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 IBA57-202ENST00000484749 9815 ntTSL 513.38□□□□□ -0.271e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 PRR3-204ENST00000481741 1944 ntTSL 213.25□□□□□ -0.291e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 PCYT2-209ENST00000572157 442 ntTSL 413.22□□□□□ -0.291e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 DYNC1LI2-214ENST00000569320 641 ntTSL 313.16□□□□□ -0.31e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 NMRAL1-210ENST00000573533 756 ntTSL 213.08□□□□□ -0.321e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 METTL2B-201ENST00000262432 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.361e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 METTL2B-205ENST00000481392 564 ntTSL 312.46□□□□□ -0.411e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 METTL2B-206ENST00000482555 1590 ntTSL 1 (best)11.98□□□□□ -0.491e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 COX17-203ENST00000484810 471 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.521e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 SSBP2-216ENST00000512923 1336 ntTSL 511.67□□□□□ -0.544e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 SLC25A21-201ENST00000331299 2785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.551e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 FBXO3-201ENST00000265651 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.571e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 METTL2B-204ENST00000480046 5743 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.571e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 ELP3-201ENST00000256398 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.691e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 DNAJC19-205ENST00000479269 610 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.721e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 ELP3-202ENST00000380353 3078 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.771e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 ELP3-219ENST00000537665 3053 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.771e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 SSBP2-205ENST00000505980 1521 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.84e-7■□□□□ 9.1
PABPC4Q13310 ELP3-210ENST00000521015 3158 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.811e-7■□□□□ 9.1
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