Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms