Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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RPA4Q13156 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPA4Q13156 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RPA4Q13156 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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RPA4Q13156 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPA4Q13156 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RPA4Q13156 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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RPA4Q13156 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RPA4Q13156 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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RPA4Q13156 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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