Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NFX1Q12986 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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