Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NPRL3Q12980 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms