Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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PTPRJQ12913 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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PTPRJQ12913 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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PTPRJQ12913 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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PTPRJQ12913 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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PTPRJQ12913 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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PTPRJQ12913 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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PTPRJQ12913 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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