Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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EFEMP1Q12805 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EFEMP1Q12805 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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