Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TWF1Q12792 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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