Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSC1Q08554 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms