Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERCC6Q03468 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms