Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MS4A2Q01362 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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