Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BP2P78314 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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