Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCE1P61221 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms