Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms