Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CLDN15P56746 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms