Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SMSP52788 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMSP52788 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMSP52788 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMSP52788 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMSP52788 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMSP52788 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMSP52788 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMSP52788 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMSP52788 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMSP52788 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMSP52788 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMSP52788 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMSP52788 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMSP52788 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMSP52788 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMSP52788 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMSP52788 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMSP52788 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMSP52788 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMSP52788 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SMSP52788 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SMSP52788 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMSP52788 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMSP52788 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMSP52788 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMSP52788 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMSP52788 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMSP52788 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMSP52788 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMSP52788 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMSP52788 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMSP52788 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMSP52788 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMSP52788 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMSP52788 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SMSP52788 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMSP52788 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMSP52788 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMSP52788 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMSP52788 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SMSP52788 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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