Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KRT6CP48668 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KRT6CP48668 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRT6CP48668 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KRT6CP48668 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRT6CP48668 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KRT6CP48668 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KRT6CP48668 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRT6CP48668 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KRT6CP48668 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRT6CP48668 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KRT6CP48668 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRT6CP48668 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRT6CP48668 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KRT6CP48668 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRT6CP48668 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KRT6CP48668 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRT6CP48668 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRT6CP48668 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRT6CP48668 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRT6CP48668 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KRT6CP48668 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRT6CP48668 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KRT6CP48668 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KRT6CP48668 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms